Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXF2Q12947 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXF2Q12947 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXF2Q12947 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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