Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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