Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms