Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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