Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TROQ12816 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TROQ12816 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TROQ12816 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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