Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNA1Q09470 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms