Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms