Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms