Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms