Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms