Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms