Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO4P61968 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO4P61968 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO4P61968 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO4P61968 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO4P61968 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO4P61968 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO4P61968 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO4P61968 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO4P61968 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO4P61968 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO4P61968 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO4P61968 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO4P61968 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO4P61968 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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