Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 FER1L5-206ENST00000624922 6367 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 SPTBN5-201ENST00000320955 11725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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TMEM258P61165 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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TMEM258P61165 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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TMEM258P61165 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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TMEM258P61165 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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TMEM258P61165 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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TMEM258P61165 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TMEM258P61165 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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