Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCDC1P59894 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms