Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GJA9P57773 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GJA9P57773 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms