Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BRPF1P55201 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF1P55201 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms