Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFSP49914 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFSP49914 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFSP49914 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFSP49914 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFSP49914 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MTHFSP49914 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFSP49914 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms