Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NESP48681 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NESP48681 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NESP48681 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NESP48681 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NESP48681 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NESP48681 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NESP48681 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NESP48681 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NESP48681 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NESP48681 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NESP48681 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NESP48681 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NESP48681 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NESP48681 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NESP48681 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NESP48681 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NESP48681 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NESP48681 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NESP48681 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NESP48681 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NESP48681 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NESP48681 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NESP48681 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NESP48681 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NESP48681 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NESP48681 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NESP48681 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NESP48681 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NESP48681 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NESP48681 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NESP48681 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NESP48681 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms