Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTR1BP42025 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTR1BP42025 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTR1BP42025 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTR1BP42025 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTR1BP42025 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTR1BP42025 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTR1BP42025 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTR1BP42025 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTR1BP42025 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTR1BP42025 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms