Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms