Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms