Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms