Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms