Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms