Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRHP20396 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRHP20396 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRHP20396 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms