Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 OR4C5-201ENST00000319813 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AL513285.1-201ENST00000423187 432 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC096732.1-201ENST00000439565 477 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC093297.2-201ENST00000503452 738 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 MEG8-208ENST00000553465 1176 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 RN7SL819P-201ENST00000581896 270 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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