Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HKR1P10072 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HKR1P10072 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms