Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYBBP04839 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms