Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB5O95377 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB5O95377 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB5O95377 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GJB5O95377 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GJB5O95377 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GJB5O95377 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB5O95377 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms