Protein–RNA interactions for Protein: O75368

SH3BGRL, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRLO75368 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms