Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms