Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLX3O43711 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLX3O43711 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLX3O43711 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms