Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DENRO43583 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms