Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNPHO15079 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNPHO15079 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SNPHO15079 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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SNPHO15079 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SNPHO15079 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNPHO15079 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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