Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCRL2O00421 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms