Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
E9PBE3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E9PBE3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E9PBE3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E9PBE3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E9PBE3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E9PBE3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E9PBE3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E9PBE3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E9PBE3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E9PBE3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E9PBE3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E9PBE3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E9PBE3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms