Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DGG1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DGG1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DGG1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DGG1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DGG1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B4DGG1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DGG1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms