Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms