Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PARP3Q9Y6F1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PARP3Q9Y6F1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PARP3Q9Y6F1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PARP3Q9Y6F1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PARP3Q9Y6F1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PARP3Q9Y6F1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms