Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms