Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms