Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms