Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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