Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms