Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms