Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.1 ms