Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms