Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms