Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms