Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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IFT27Q9BW83 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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IFT27Q9BW83 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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IFT27Q9BW83 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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IFT27Q9BW83 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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IFT27Q9BW83 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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IFT27Q9BW83 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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