Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV73

CEP250, Centrosome-associated protein CEP250, humanhuman

Predictions only

Length 2,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP250Q9BV73 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP250Q9BV73 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms